在本作中不仅可以从击倒的特定人处获得强化零件，还可以获得“技能零件”。“技能零件”可以装备在驾驶员身上使其能力值提高，而且“技能零件”的种类多种多样。但是每位驾驶员可以装备的“技能零件”数量是有限的，所以要根据各人不同的能力以及机体的性能来进行装备。

    本作中将会把在2004年发售的《超级机器人大战MX》中初次出现的“喜欢机体选择系统”复活，而且本作中可以选择的作品数量增加为3部。在游戏开始时玩家将进行选择，而在游戏中被选中作品中的机体的可改造的最高阶段为15段（普通为10段）。

     另外据推测，在本作中可以进行驾驶员的培养、机体的换装以及主人公机体武器名的变更。